Принятое деление музеев на естественноисторические, технические, исторические, литературные, художественные трудно применять к московским собраниям, ибо некоторые московские музеи располагают памятниками истории, памятниками искусства и материальной культуры такой значимости, что могут быть отнесены к различным категориям. На нашем сайте отображены лишь самые крупные и известные собрания памятников искусства, у каждого из которых есть собственный технический регламент.
В нее не вошли небольшие музеи, имеющие преимущественно мемориальное значение, например музеи художника В. Васнецова и скульпторов А. Голубкиной, С. Коненкова. Не включен Музей народного искусства Научно-исследовательского института художественной промышленности, ибо он по своему характеру и структуре значительно отличается от большинства московских музеев. Не вошли в издание Государственный театральный музей, обладающий многими шедеврами художников сцены, и литературный Музей А. С. Пушкина, хранящий уникальные Произведения декоративного искусства первой трети XIX века.
В их экспозиции произведения искусства призваны играть вспомогательную роль иллюстрации процессов развития театра или литературы. Не включены в книгу историко-революционные музеи, такие, как Центральный музей В. И. Ленина, Центральный музей Революции СССР, Центральный музей Вооруженных Сил СССР, так как здесь картины, скульптура, графика также служат лишь дополнительным материалом. В то же время в книге представлены филиалы Государственного Исторического музея, снискавшие известность как сокровищницы древнерусской архитектуры и живописи.


