Отдельная часовня на этом месте существовала уже в середине XI века и предназначалась ли для княжеских захоронений, то ли для заупокойных богослужений. По мнению Н. М. Никитенко, она была назначена Петром Могилой для хранения найденных им мощей св. Владимира, но эти планы остались нереализованными. По мнению этой же исследовательницы, именно в этом помещении с 1 января по 9 марта 1647 стоял гроб с телом Петра Могилы.
Часовня представляет собой прямоугольное в плане помещение с полукруглой низкой абсидой посередине восточной стены, перекрыто сводом. Зондаж показал значительные перестройки стен и сводов, поэтому последние тоже можно датировать временами Могилы) . На восточной стене над абсидой - круглое окно. В толще северной и южной стен на всю их длину находятся ниши (возможно, еще древнерусского времени), напоминающие погребальные аркосолии. В центре западной стены - вход, разрублен конце XVII века. Снаружи над ним сохранились остатки портала (также Могилянского времени) - две пилястры, поддерживающие треугольный фронтон с росписью Богоматери Оранты. Круглое окно и особенно формы портала отчетливо ассоциируются со стилем ренессанс. Портал с треугольным фронтоном напоминает форму наличников окон второго яруса центрального объема Борисоглебской церкви. Часть плохо сохранившихся росписей в часовне, посвященных Богородице, датируется эпохой Могилы, а часть- 20-ми годами XVIII века.
На одном из рисунков А. ван Вестерфельда видим также изображения раки митрополита Макария, мощи которого считались одной из главных святынь Софийского собора. Рака стоит возле роскошного алтаря в виде арки, обрамленной двумя колоннами с коринфским капителями и резными стволами, которые вызывают в памяти известные ренессансные или передбарокови резные колонны Львова и Львовщины (Черный каменный, Дунаев и др.). Колонны поддерживают двойной карниз с волютами. Выше - роскошный резной маньеристичний или ранньобароковий фронтон с гербом в центре.


